Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc47Q505F5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc47Q505F5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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