Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Smim26Q3V460 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms