Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pacs2Q3V3Q7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pacs2Q3V3Q7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pacs2Q3V3Q7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pacs2Q3V3Q7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pacs2Q3V3Q7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms