Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms