Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prdm6Q3UZD5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms