Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms