Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms