Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms