Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cog7Q3UM29 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms