Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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