Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lrrc58Q3UGP9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lrrc58Q3UGP9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms