Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms