Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
YrdcQ3U5F4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms