Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud5Q3U2S4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms