Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms