Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms