Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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