Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Srsf6Q3TWW8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms