Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ctdnep1Q3TP92 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ctdnep1Q3TP92 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ctdnep1Q3TP92 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms