Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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