Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ptchd1Q14B62 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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