Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Traf3ip1Q149C2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms