Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms