Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli2Q0VGT2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli2Q0VGT2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms