Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms