Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
StumQ0VBF8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
StumQ0VBF8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms