Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms