Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrioQ0KL02 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms