Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc21bQ0HA38 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms