Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms