Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col9a2Q07643 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms