Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms