Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms