Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox10Q04888 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sox10Q04888 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox10Q04888 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox10Q04888 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox10Q04888 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox10Q04888 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox10Q04888 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox10Q04888 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox10Q04888 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms