Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnb1Q03717 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms