Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms