Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb5Q02739 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gjb5Q02739 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb5Q02739 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms