Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms