Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms