Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grin2bQ01097 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms