Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde1bQ01065 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Pde1bQ01065 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms