Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms