Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms