Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfra1P97785 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms