Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcc1P97496 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms