Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms