Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tp53bp1P70399 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tp53bp1P70399 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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