Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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