Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkn1P70268 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pkn1P70268 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms