Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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